pyublas使うまでのメモ

環境はUbuntu12.04、Boostはインストール済みとする。ちなみに1.46

まずはPyUblasのインストール

ここから最新版をダウンロード http://pypi.python.org/pypi/PyUblas

tar xvzf PyUblas-VERSION.tar.gz

解凍して

cd PyUblas-VERSION
./configure.py --boost-python-libname=boost_python --use-iterators
sudo make install

boost-python-libnameは/usr/libにあるlibboost_python*.soのlibと.soを除いた部分を設定。

今回はCMakeでサンプルをビルドしてみた。別にMakeでもよい

cd test

すると

sample_ext.cppとsample.pyがある

自分で考えろという意味なのか、Makefileとかがない。

調べると必要なものは

Include: boost, python, pyublas

Library: boost_python, python

で、自分の環境では、

Include:

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/PyUblas-ほげほげ/include

/usr/lib/python2.7

Library:

/usr/lib/libboost_python.so

/usr/lib/libpython2.7.so

にあった

ちなみに、PyUblasのIncludeパスはhttp://documen.tician.de/pyublas/faq.html#where-do-the-headers-get-installedを参考に見つけた。

これを元に、Makefileを作っても良いが、楽をするために、CMakeでやった。

cmake_minimum_required(VERSION 2.8)

find_package(Boost COMPONENTS python REQUIRED)
find_package(PythonLibs REQUIRED)
find_path(PYUBLAS_DIR pyublas /usr/local/lib/python2.7/dist-packages/PyUblas-2011.1-py2.7-linux-x86_64.egg/include)

# 共有オブジェクトを作成する
add_library(
  sample_ext
  SHARED
  sample_ext.cpp
)

# インクルードディレクトリ -Iにあたる
include_directories(
  ${Boost_INCLUDE_DIRS}
  ${PYTHON_INCLUDE_DIR}
  ${PYUBLAS_DIR}
)

# リンクディレクトリ -Lにあたる
link_directories(
  ${Boost_LIBRARY_DIRS}
)

# リンク -lにあたる。libboost_python.soとlibpython2.7.soが設定されている
target_link_libraries(
  sample_ext
  ${Boost_LIBRARIES}
  ${PYTHON_LIBRARIES}
)

# libsample_extとならないようにする
set_target_properties(
  sample_ext
  PROPERTIES PREFIX ""
)

パッケージが見つからなかったときの処理とかは書いていない。
これをCMakeLists.txtというファイル名でsample_ext.cppと同じディレクトリにおいて、
そこから

mkdir build
ccmake ..

して見つからなかったところを設定して、（特にPYUBLAS_DIRのところ）
ジェネレートして、makeして、OKだったら

mv sample_ext.so ../
cd ..
python sample.py

２倍されている結果が帰ってくる